在游戏《红警3》中，天皇是日本帝国的最高领导人，他是日本的统帅，掌握了帝国的军队和政治。然而，由于他采用了过激的战争策略，导致在太平洋战争中日本处于劣势，最终被美国等国家打败。在游戏中，天皇最终遭到了毁灭，具体方式如下：
1. 将军突袭：在游戏中，天皇的大本营位于一座小岛上，而玩家可以选择通过派遣兵力将岛上的基地摧毁，或者使用特种部队对天皇进行直接攻击。其中，将军是一种特种部队，可以通过潜入岛屿去直接刺杀天皇，以达到击杀目的。
2. 远程攻击：除了派遣部队和使用特种部队外，玩家还可以通过火箭、炮弹、导弹等远程武器对天皇进行攻击。这种攻击方式难度较大，需要玩家根据天皇的位置和移动路线，精准预测，并投放合适的武器，才能造成致命的打击。
3. 导弹攻击：在游戏的最终关卡，指挥官出现了可以发射核弹头的飞机。玩家可以通过操纵该飞机，飞到天皇所在的小岛上，发射核弹头摧毁天皇大本营，将天皇致于死地。
综上所述，天皇最终死亡的方式有很多种，不同的攻击方式难度、造价等都不同，需要玩家根据实际情况进行选择。而在游戏中，击败天皇后，日本帝国终于结束了暴政，重新走上了和平的道路。
