要想打败红警3中的海盗船长，需要考虑以下几个方面：
1. 建造正确的建筑
首先，你需要建造适合当前战斗的建筑。如果你面对的是海盗船长，那么你应该尽量建造一些防御塔、炮塔和火箭炮等建筑来对抗海盗船长的船只攻击。此外，你还可以建造巨型机器人来挡住敌人的船只。
2. 确认船只数量
打败海盗船长需要考虑到敌人船只数量的问题。建议在攻击前先观察敌方船只数量和种类，根据实际情况派遣自己的船只作战，在船只数量相等的情况下，要尽量利用自己的船只优势，如采用先锋战术，先派出小型船只进行攻击，磨去敌方的战斗力，最后再使用大型船只完成最后的攻击。
3. 使用科技武器
使用科技武器是打败海盗船长的另一个有效策略，例如，使用磁暴弹来打击敌人的船只，或者使用热能或粒子射线来攻击敌人。科技武器的目的是在瞬间造成巨大损害，并缩短战斗时间，因此科技武器的使用时机非常重要。
4. 利用地形
利用地形来打败敌人是一个很好的策略。例如，在海上，你可以让自己的船只躲在深水处，而敌人的船只只能在浅水区航行，这会给自己带来很大的优势。你还可以利用海洋潮汐来控制敌人的位置，让敌人无法逃脱你的攻击。
总之，打败海盗船长需要你综合运用建筑、船只、科技武器和地形等战术手段，灵活应对敌人的攻击，从而实现胜利。
